En el año1932, en los albores de la guerra del Chaco; un puñado de jóvenes jugadores de fútbol del equipo de San Francisco de La Recoleta, en un impulso de rebeldía ante la no inclusión de sus nombres en las listas de este plantel, conciben la idea de independizarse del mismo, para conformar un nuevo club que les permitiera continuar con la práctica del deporte popular, que era su pasión.
De esa manera, un día 4 de abril de 1932, reunidos en el domicilio particular del futbolista Julio Cueto, ubicado en el barrio de La Recoleta o Santa Ana, alentados fervientemente por los sacerdotes franciscanos Tomás Aspe y Francisco Aguinaco, más el profesor Isidoro Arguedas, quienes proclamaron mediante un acta, la creación del "Independiente Sporting Club", asignándole a su divisa los colores rojo y amarillo de la bandera española, como homenaje y reconocimiento a los sacerdotes hispanos, verdaderos impulsores del deporte en Sucre, particularmente, en las Escuelas Franciscanas de La Recoleta.
Entre los fundadores se destacan: Gerardo Arguedas, Julio Cueto, Teodoro Aldayuz, Roberto Marzana, Gregorio Córdova, Leonardo Coronado, José Gumiel, Miguel Hernández, Armando Moscoso, Vicente Bolaños, Guillermo Echalar, Juan Rojas, José Guerra, Florentino Reyes, José Reyes, Alberto Salas, los hermanos Rodríguez, Barahona, Sandi, Bozo y Paniagua. Posteriormente, se incorporaron Julián Núñez y Julio Cors.
Ese mismo año, el Independiente fue inscrito en la Sucre Football Asociation, hoy, Asociación Chuquisaqueña de Fútbol, proclamándose campeón invicto de su categoría, con el derecho de participar a partir de 1933 en la División de Honor del Fútbol Chuquisaqueño, junto a tradicionales clubes de esa época como Stormer's, Junín, Comercio Atlantes, 25 de Mayo y, otros prestigiosos planteles.
Pasados unos años, el club cambiaría de denominación a "Club Independiente Sociedad Deportiva". En esa transición, el 20 de enero de 1953, por determinación de los trabajadores petroleros del Distrito de Chuquisaca, reunidos en asamblea general, se procedió a la elección del directorio del nuevo "Club Independiente Petrolero", la misma que estaba conformada por Enrique Querejazu; presidente, Avelino Taborga; vicepresidente, René Liévana; secretario general, Enrique Palacios; secretario de hacienda y secretario de deportes, Julio Flores. Los colores elegidos para la indumentaria deportiva fueron camiseta una blanca con cuello y vivos rojos, pantalón corto blanco; con la alternativa de camiseta roja con vivos blancos y pantalón corto blanco, simbolizando el rojo como recuerdo permanente a los hombres que fundaron esta institución y el blanco en homenaje a la ciudad blanca de Sucre, cuna de la independencia de Bolivia.
En 1990, luego de su paso fugaz por la Liga del Fútbol Profesional Boliviano, entre 1982 y 1983, retorna al seno liguero por méritos propios, logrando mantenerse hasta el año 2003 como el único representante chuquisaqueño. Actualmente el club esta en la primera del Futbol Chuquisaqueño, constituyendose en el plantel que mas hinchada tiene en Sucre "la mitad mas uno".